二代健保上路後，，民眾利息、兼差收入等，都要加課補充保費，保費公平性屢屢受到質疑，繼投保最高級距只設到18萬兩千，也就是說不管收入多高，月薪20萬跟月薪百萬，要繳的保費都一樣，被批實在不合理後。民間監督健保聯盟現在又發現，年資滿30年的公務員，可以因為公保法保障，健保費一毛都不用繳，由政府全額補助，換句話說，每年這多出來的四億元等於要全民買單，痛批這個制度「雖然合法，但卻不合理」。
二代健保即將上路，但補充保費不公爭議也不斷，民間監督健保聯盟針對收取保費的公平性，再度砲轟。民間監督健保聯盟召集人孫友聯說：「年資30年以上的公務人員，事實上他的薪水，已經是相當優厚，為什麼一個失業勞工，都要自己繳保費，而一個年資30年的公務人員保費，竟然是由國家編列預算幫他付」。
沒收入老百姓的苦籌保費，年資滿30年，年薪超過八萬的老公務員，卻因為早就併入健保的公務人員保險法，享有全額的健保補助，制度如果不改，政府每年為這3萬8千多人付出高達4億多元的保費，等於要全民買單。
民眾覺得，物價漲不停，一般民眾的生活壓力日漸增加，而公務員的健保費居然還要全民買單，痛批這根本不公平不正義。也有民眾說「那大家都不要付好了，幹嘛改二代健保」。民眾火大，但健保局也無奈，礙於法源不同，只能盼到公保修法才能改變不合理的舊制度。但看看二代健保，已經因為保費最高投保設下級距18萬2，但許多大老闆大多超過這薪水，最多每個月也只繳兩千八百多塊，它的公平性也再度被攤開檢驗，還不想想辦法，難不成真的要讓健保破產，全民都吃虧。
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